Entrée dans la fonction publique de l’État comme Commissaire de la concurrence et de la consommation à la direction départementale du Haut-Rhin, elle a été formatrice à l’École nationale de la DGCCRF* à Montpellier, puis en tant qu’inspectrice principale ou directrice départementale, elle a œuvré pour la protection des droits des consommateurs et la régulation de l’économie (dans l’Hérault, l’Aude, le Lot, l’Aube, l’Isère).

À la création des Direccte en 2010, elle est nommée directrice régionale de Bourgogne, puis en 2015 de la Direccte d’ Aquitaine, et en 2016 de la Direccte Nouvelle-Aquitaine.

Isabelle Notter est Chevalier de l’ordre de la Légion d’honneur et Officier de l'ordre national du Mérite. Elle est une germaniste émérite.

Étant née à Metz, la nouvelle directrice retrouve sa région d'origine.

*DGCCRF :  Direction Générale de la Concurrence, de la Consommation et de la Répression des Fraudes